Código para escribir un archivo con JAVA
try {
// el segundo parametro,
// true para agregar texto,
// false para limpiar el archivo y agregar nuevo contenido
FileWriter file_log = new FileWriter("C:\\sql\\file.sql", false);
file_log.write("Contenido del archivo");
file_log.close();
} catch (SQLException f) {
System.out.println(f.getMessage());
}